Es werden im Grunde drei zeitliche Phasen entsprechend des Verarbeitungsortes im Gehirn unterschieden:

1.

Frühe Latenzen FAEPs oder Brainstem AEPs

Hirnstamm
ca. 1 - 10 ms nach Reiz

2.

Mittlere Latenzen MLAEP

Mittelhirn
ca. 10 - 50 ms nach Reiz

3.

Späte Latenzen SAEP oder Late Latency LLAEP:

Großhirn
ca. 50 - 100 ms nach Reiz

Die Signalveränderungen des gemessenen EEGs durch den akustischen Reiz sind von sehr kleiner Amplitude und müssen durch Mittelungsverfahren extrahiert werden. Der AEP/2–Monitor benutzt hierzu eine spezielle Softwarefilterung, die besonders effektiv ohne lange Wartezeiten eine zuverlässige Extraktion ermöglicht. Das gleiche Software-Verfahren wird angewendet bei Bildentstörungen von Zielerfassungskameras in Hubschraubern, die die Rotor-bedingten Vibrationen schnell und sicher eliminiert. Die Extraktion erfolgt in ca. 2 - 6 Sekunden.